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Communities of Rhopalocera (Lepidoptera) butterflies in 24 urban parks in Marseille Sampling of Rhopalocera communities: 7 to 12 transects in each of 24 urban parks in Marseille every 2 years since 2008. Increasing numbers of cities are currently developing sustainable policies aimed at promoting urban biodiversity and ecological dynamics through the planning of green networks and the implementation of more sustainable management practices. These human activities can strongly influence environmental factors on which the organization of ecological communities at different scales depends. Thus, it is of fundamental importance to understand the relative impact of local management, green space design and landscape features on the distribution and the abundance of species in urban areas. On the basis of 2 years of butterfly surveys in urban public parks within an extensive Mediterranean metropolitan area, Marseille (South-East France), the aim of this paper is to provide a better understanding of the effect of these three environmental scales (plot, park, landscape) on the composition and organization of species assemblages. Using variation partitioning and nestedness analysis on ecological data aggregated at plot-level and park-level respectively, we demonstrate the preponderant effect of landscape scale features on urban butterfly assemblages. Our results also highlight an important co-variation of plot management, park layout and urban landscape features, in their interaction with the community structure of urban butterflies. Although there is no significant species-area relationship, significantly nested patterns arise in species composition. Selective colonization appears as a driving force constraining the constitution of species assemblages within the city. However, a prospective study on adjacent more natural areas suggests that biotic limitations, interspecific competition and habitat filtering may play an important role if a larger portion of the urbanization gradient is explored, which remains to be investigated.
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Suivi longitudinal sur 9 sites de terrain au Sénégal de l’observatoire ObsMiCE Paramètres mesurés: - détermination spécifique ; - indices d’abondance ; - données morphométriques, - estimation de l’âge, - paramètres de reproduction indicateurs de la dynamique des populations animales ; - prélèvements de tissus, d’ectoparasites et d’endoparasites ; - données environnementales ; - prévalence de parasites et pathogènes
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L’île de Bagaud, réserve intégrale du Parc National de Port Cros (PNPC), fait actuellement l‘objet d’un programme décennal de restauration écologique en vue de la préservation de son patrimoine naturel. Cette restauration consiste à contrôler deux espèces exotiques envahissantes : le rat noir (Rattus rattus) et la griffe de sorcière (Carpobrotus sp.). Débuté en 2010, ce programme permet l’étude de plusieurs groupes taxonomiques avant (2010-2011) et après contrôle (2013-2019) : (1) la flore, (2) les arthropodes épigés et les insectes volants, (3) les squamates, (4) les oiseaux terrestres nicheurs et (5) les oiseaux marins nicheurs. Ce projet fédère une large communauté d’acteurs académiques et non-académiques autour d’un objectif commun : contrôler et si possible éradiquer les espèces invasives de la réserve intégrale et suivre la résilience des groupes taxonomiques cités ci-dessus. Partenaires pour le suivi et l’analyse des données : IMBE, PNPC, CBNMed, association Reptil’Var, association DREAM et LPO. Autres partenaires : PIM, INRA, Conservatoire du Littoral, Domaine du Rayol, Naturoscope, UE, Natura2000, TLV, Région Sud, Naturalia Consultants en Environnement.
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The Health and Demographic Surveillance System (HDSS) in Niakhar, a rural area of Senegal, is located 135 km east of Dakar. This HDSS has been set up in 1962 by the Institut de Recherche pour le Développement (IRD) to face the shortcomings of the civil registration system and provide demographic indicators. Some 65 villages were followed annually in the Niakhar area from 1962 to 1969. The study zone was reduced to eight villages from 1969 to 1983, and from then on the HDSS was extended to include 22 other villages, covering a total of 30 villages for a population estimated at 45,000 in December 2013. Thus 8 villages have been under demographic surveillance for almost 50 years and 30 villages for 30years. Vital events, migrations, marital changes, pregnancies, immunization are routinely recorded (every four months). The database also includes epidemiological, economic and environmental information coming from specific surveys. Data were collected through annual rounds from 1962 to 1987; rounds became weekly from 1987 to 1997; routine visits were conducted every three months between 1997and 2007 and every four months since then. The current objectives are 1) to obtain a long-term assessment of demographic and socio-economic indicators necessary for bio-medical and social sciences research, 2) to keep up epidemiological and environmental monitoring, 3) to provide a research platform for clinical and interdisciplinary research (medical, social and environmental sciences). Research projects during the last 5 years are listed in Table 2. The Niakhar HDSS has institutional affiliation with the Institut de Recherche pour le Développement (IRD, formerly ORSTOM). * Niakhar HDSS INDEPTH Core Dataset 1984-2016 (Release 2018). Provided by the INDEPTH Network Data Repository. http://indepth-ishare.org/index.php/catalog/132 * DOI : 10.7796/INDEPTH.SN013.CMD2016.v1 * https://doi.org/10.7796/INDEPTH.SN013.CMD2016.v1
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Une infrastructure de recherche européenne de mesure des concentrations atmosphériques des gaz à effet de serre et des flux de carbone sur les écosystèmes et l’océan. La tour ICOS (pour Integrated Carbon Observation System) installée à l'Observatoire de Haute Provence (OHP), haute de 100 m est une antenne régionale du dispositif permettant d’étudier la place de la forêt méditerranéenne dans le bilan de carbone. Elle est équipée d’instruments à trois niveaux (10, 50, 100 m). Le réseau est doté de 3 types de stations réparties sur le territoire : continentales, côtières et de montagne. Chacune de ces stations mesure les paramètres suivants : * température, direction et vitesse du vent, pression atmosphérique, humidité * CO2, CH4, CO, H2O * hauteur de couche limite atmosphérique (lidar) Les objectifs scientifiques de ce programme européen sont de : * tracer les flux de carbone en Europe et dans les régions adjacentes par observation des écosystèmes, de l'atmosphère et des océans à travers des réseaux intégrés, * fournir les observations à long terme nécessaires pour comprendre l'état présent et prévoir le comportement du carbone global et des émissions des gaz à effet de serre, * surveiller et évaluer l'efficacité de la séquestration du carbone et/ou de la réduction des émissions de gaz à effet de serre sur la composition globale de l'atmosphère, en prenant en compte les sources et les puits par région géographique et par secteur d'activité. L'infrastructure ICOS permet d'accueillir des chercheurs pour des campagnes de recherches
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L’Observatoire du milieu porté par le GIPREB (Groupement d’Intérêt Publique pour la Réhabilitation de l’Etang de Berre) a pour vocation de suivre depuis 1994 l’évolution hydrologique et biologique de l’étang de Berre (France, Méditerranée). Le suivi mis en place au sein de l’Observatoire du GIPREB répond pour l’étang de Berre aux quatre grandes problématiques que sont : - le contrôle des apports par les bassins versants, - le contrôle de l’eutrophisation, - la contamination et - le niveau de réponse des biocénoses et habitats. L’étang de Berre, d’une superficie de 155 km2 et une lagune saumâtre (qualifiée d’« eaux de transitions » au titre de la directive-cadre sur l’eau) située dans les bouches du Rhône (France) . Sa profondeur moyenne est de 6,5 mètres, pouvant atteindre 9 mètres au centre de l’étang. Elle est reliée à la mer méditerranée par le chenal de Caronte au sud et reçoit l’eau des trois rivières que sont la Touloubre, l’Arc et la Durançole. Au sud l’étang de Bolmon (en communication avec l’étang de Berre) reçoit lui les eaux de la Cadière. Ses apports du bassin versant naturel sont complétés par ceux de la chaîne hydro-électrique Durance-Verdon dont les eaux douces sont rejetées sur les rivages nord de l’étang. (CF carte). La population du bassin versant naturel (1 700 km²) de l’étang de Berre s’élève à 600 000 habitants. Les vents sont caractérisés par deux secteurs dominants : N-NW (le mistral est le vent dominant et fréquent) et S-E. L’étang de Berre constitue un milieu eutrophe avec de fréquentes efflorescences algales et des phénomènes récurrents d’appauvrissement ou de disparition de l’oxygène de ses eaux. - informations sur l'étang de Berre : https://etangdeberre.org/comprendre/generalites-sur-letang-de-berre/ Bases de données mises à disposition : ============================== - Hydrologie : • Haute Fréquence en une station (H12) depuis 2020 : S, O2, Température à trois profondeurs (surface – milieu – fond) • Prélèvement mensuel en 10 stations en surface et fond depuis 1994 : O2, NH4, NO2, NO3, PO4, SiOH4, Nt/Pt, COP/NOP, MES, Chla/Pheo • Profil de sonde mensuel en 10 stations depuis 1994 : S, O2, T°C - Espèces benthiques depuis 2002 : Prélèvement mensuel en 8 stations - Phytoplancton : Prélèvement mensuel en 2 stations - Macrophytes depuis 2001 : Comptage annuel des macrophytes sur 31 transects - Herbier de Zostère depuis 2004 : Cartographie annuelle de tous les herbiers dans l’étang (format .shp)
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Hourly High Frequency Radar (HFR) surface current data (ocean surface velocity) from 2 different stations located on the French Mediterranean coast (Toulon), processed in real time. The total velocity is then reconstructed from the filled radial velocity files, and projected onto a cartesian grid of 1km x 1km. The HFR data comes from two systems, one monostatic radar PEY (located at Fort Peyras, La Seyne sur mer), and one bistatic POB (receiver located at Cap Bénat - Bormes les Mimosas, and transmitter on Porquerolles Island). The HFR data is initially hourly sampled. The radial velocity are processed by an algorithm of Directional of Arrival Finding with a self-calibration method developed by our laboratory. HF radar sites : - Peyras : 43°03'47.4"N, 5°51'40.3"E - Porquerolles (transmitter only): 42°58'59.0"N, 6°12'15.3"E - Bénat (receiver only): 43°05'31.5"N, 6°21'26.5"E EUROPEAN DIRECTORY OF MARINE ENVIRONMENTAL RESEARCH PROJECTS (EDMERP) : - SICOMAR PLUS(12402), IMPACT(12271), MOOSE(11574), and JERICO NEXT(12227) EQUIPEMENTS: - High Frequency Surface Wave radar WERA from HELZEL MESSTECHNIK PARAMETERS: - sea surface current Citation: - Dylan Dumas, Charles-Antoine Guerin, Self-calibration and antenna grouping for bistatic oceanographic High-Frequency Radars,2020, https://arxiv.org/abs/2005.10528
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The Rochelec dataset gathers petrophysical and geoelectrical data from the Rochechouart impact structure (France). Since 2017, about 10 geophysical field campaigns were performed on this eroded structure. Among other techniques, geophysical downhole logging, electrical resistivity tomography and controlled-source audiomagnetotelluric data were acquired. In parallel, we measured the electrical resistivity and porosity of some core samples coming from drillings performed in fall 2017 at several sites of the impact structure. These multiscale electric data allows to better characterize the different lithologies outside the drilling sites, and their associated geometry. * Citation of this dataset Quesnel, Y., Sailhac, P., Lofi, J., Lambert, P., Rochette, P., Uehara, M. & Camerlynck, C. (2021). RochElec : Geoelectrical investigations on the Rochechouart impact structure (France) [Data set]. CEREGE UMR 7330 CNRS. https://doi.org/10.34930/BE0549D1-E876-49C5-B07F-BF04D398B25E * Publications linked with the dataset: Quesnel, Y., Sailhac, P., Lofi, J., Lambert, P., Rochette, P., Uehara, M. & Camerlynck, C. (2021). Rochechouart impact structure, France. Geochemistry, Geophysics, Geosystems, 22, e2021GC010036, https://doi.org/10.1029/2021GC010036
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Wind is generated from left to right by an imposed constant horizontal pressure gradient. The initial wind field is disturbed by small random variations so as to produce a turbulent field. Withouth the perturbations, a viscous solution would be found. The numerical resolution technique used is based on finite differences, applied to a structured mesh. The Continuity and Navier-Stokes equations are solved with the well-known half time-step method, in which the Poisson equation is solved over the entire domain at each time iteration. As of 17 March 2022, the code version is DNS_2D_for_Teaching-v1.0.0. The code is written in C language. A GUI (Graphical User Interface) is available as an executable file "sdiapp.exe" that can be run under most versions of Microsoft Windows. Please just make sure to check the 'graph' box before clicking on the launch button, to have the visual experience. On the GUI, two graphs give an overview of the real time simulation. The top graph shows the 2D (x,z) vorticity, while the bottom graph shows the wind speed. The colour bars are not shown, but they are classical tables in which blue means small values, while red colours denote large values. The authors of this code version are Francis Vivat (LATMOS UMR CNRS 8190) and Denis Bourras (MIO UMR 7294). The code is distributed freely and comes with no garantees. It was mainly designed for educational purposes. Please note that the rules of use must follow the CeCILL-C FREE SOFTWARE LICENSE AGREEMENT included in the distribution. Any return is welcomed and encouraged, please contact francis.vivat@latmos.ipsl.fr or denis.bourras@mio.osupytheas.fr. Citation: Vivat, F., & Bourras, D., (2023). DNS_2D_for_Education [Application].
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JULIO (Judicious Location for Intrusions Observations) mooring is located close to the 100 m-deep isobath (around 5.25°E and 43.13°N), offshore Marseille. With its bottom-moored (300kHz) ADCP, it enables measuring horizontal currents (every 4 m and every ½ h) through the water column, and among others, identifying periods of exchange between the Northern Current and the continental shelf. It is one crucial component in the study of the coastal-offshore gradient from Marseille to the MOOSE 42°N5°E station, and potential covariances with the MIO radar and other MIO or international observing systems, as well as with the SOMLIT site (including also an ADCP) in the bay of Marseille. Moreover, with a bottom CTD, it can detect environmental anomalies in classical hydrographic data, useful for oceanographers. As one of the rare station at the interface between the continental shelf and offshore, it will allow to observe the long-term evolution of the Northern Current in the context of climate change and anthropogenic pressure, and its potential varying impact on the Gulf of Lion. The data are of course also crucial for modellers. Moreover they show a great potential when supplementing other MOOSE data (glider and radar). Timeserie #2: - JULIO 2 - 17/09/2013 to 28/03/2014; JULIO (Judicious Location for Intrusions Observations) est situé à proximité de l'isobathe de 100 m de profondeur (environ 5,25°E et 43,13°N), au large de Marseille. Grâce à son ADCP (300 kHz), il permet de mesurer les courants horizontaux (tous les 4 m et toutes les ½ h) à travers la colonne d'eau et, entre autres, d'identifier les périodes d'échange entre le courant du Nord et le plateau continental. Il s'agit d'un élément crucial dans l'étude du gradient littoral-offshore de Marseille à la station MOOSE 42°N5°E, et des covariances potentielles avec le radar MIO et autres systèmes d'observation MIO ou internationaux, ainsi qu'avec le site SOMLIT (incluant également un ADCP) dans la baie de Marseille. De plus, avec un CTD de fond, il peut détecter les anomalies environnementales dans les données hydrographiques classiques, utiles aux océanographes. En tant qu'une des rares stations à l'interface entre le plateau continental et le large, elle permettra d'observer l'évolution à long terme du courant du Nord dans le contexte du changement climatique et de la pression anthropique, et son impact potentiel variable sur le Golfe du Lion. Les données sont bien sûr également cruciales pour les modélisateurs. De plus, ils présentent un grand potentiel en complément d'autres données MOOSE (planeur et radar). Série temporelle #2 : - JULIO 2 - 17/09/2013 to 28/03/2014;